宝宝种痘处三个月后化脓并有小洞，可能是正常的疫苗反应、局部感染、免疫功能异常、皮肤损伤或其他罕见原因所致。 1. 正常的疫苗反应：卡介苗接种后，通常在 2 周左右局部出现红肿、化脓，最后形成小溃疡和瘢痕，这是正常的免疫过程。 2. 局部感染：如果宝宝接种部位接触不洁物品或受到摩擦，可能导致细菌入侵，引起感染化脓。 3. 免疫功能异常：宝宝自身免疫功能不完善或存在缺陷，可能影响疫苗接种后的反应，导致异常化脓。 4. 皮肤损伤：不小心的磕碰、抓挠等导致接种部位皮肤受损，容易引发感染化脓。 5. 其他罕见原因：如局部皮肤的特殊疾病等。 家长应密切观察宝宝的情况，保持局部清洁干燥。如果化脓情况加重或宝宝出现发热、精神不佳等症状，应及时带宝宝到正规医院就诊。

您好像这样的情况最好是去医院检查一下看到底是什么原因引起的找出病因进行对症治疗因为很多皮肤病的症状都一样都可以出现像您这样的情况他可能是不适应那里的环境引起的皮肤过敏、也可能是湿疹等为了确诊一下到底是什么皮肤病建议您去医院让有经验的大夫给您仔细的检查一下找出病因进行对症治疗