49 岁男性查出慢性肝实质损害、胆囊结石、中度脾大，病情较为复杂。治疗需综合考虑，包括病因查找、病情评估、对症治疗、预防并发症及生活调理等。 1. 病因查找：明确慢性肝实质损害的原因，如病毒性肝炎、酒精性肝病、药物性肝损伤等，并针对性治疗。 2. 病情评估：对胆囊结石的位置、数量、症状等进行详细评估，判断是否有手术指征。 3. 对症治疗：若有疼痛等症状，可使用解痉镇痛药，如阿托品、山莨菪碱等。 4. 预防并发症：定期复查，监测肝功能、血常规等指标，预防脾功能亢进、上消化道出血等并发症。 5. 生活调理：戒烟戒酒，避免劳累，保持心情舒畅，饮食清淡，营养均衡。 6. 手术治疗：若胆囊结石症状严重，符合手术条件，可行胆囊切除术。 总之，对于这种复杂的病情，需要综合多种治疗方法，并密切关注病情变化，在医生的指导下进行规范治疗，以改善预后。

现在主要是保护肝功能，延缓肝硬化发展，防止一些并发症的，具体的诊疗方案听从本地医生的吧。