亚甲炎急性期，甲状腺突然肿大疼痛，伴头面部放射痛、发热，运用中药经验方甲内系列方剂清热解毒、散结止痛为主，对伴有高烧的患者同时配合抗病毒中药静点或退热西药对症治疗，一周左右患者的体温大多能恢复正常，甲状腺疼痛明显好转。由于甲状腺滤泡被破坏,甲状腺素大量进入血液循环,患者可以出现明显的甲亢症状,如体重减轻,神经过敏、震颤、心悸、怕热、多汗等,甲亢期约持续1～3个月。

对轻型病例采用阿司匹林或其他止痛药如用对乙酰胺基酚0.5g，3～4次/d，或用水杨酸盐0.65g，每4小时1次，可控制症状；如48h无效，在病情严重病例，如疼痛、发热明显者可短期用其他非类固醇抗炎药或应用糖皮质类固醇激素如泼尼松通常为每次10mg3次/d最多可用至40mg/d，可迅速缓解临床表现，约有5%的患者需用皮质激素来减轻症状，持续用药1～2周甚或4～8周以后减少药量共用6～8周如病人在用泼尼松24～48h无反应亚急性甲状腺炎的诊断应再评定。在治疗中随查血沉改变，可指导用药如病情需要，再次开始用泼尼松仍然有效然而皮质激素并不会影响本病的自然过程，如果皮质激素用后撤减药量过多、过快，反而会使病情加重。