12 岁女孩初潮后停经三个月，可能是由于性腺轴发育不完善、内分泌失调、营养不良、精神压力大、疾病因素等。 1. 性腺轴发育不完善：女孩在青春期，下丘脑-垂体-卵巢性腺轴的功能尚未完全成熟，激素分泌不稳定，容易出现月经不规律，包括停经。 2. 内分泌失调：如甲状腺功能异常、多囊卵巢综合征等，可能影响激素分泌，导致月经紊乱。 3. 营养不良：过度节食、挑食等导致营养摄入不足，影响身体正常发育和激素合成。 4. 精神压力大：学习压力、家庭环境等导致精神紧张，可能影响内分泌，引起月经异常。 5. 疾病因素：患有贫血、先天性生殖系统发育异常等疾病，也可能导致停经。 总之，12 岁女孩初潮后停经三个月的原因较为复杂。家长应重视，及时带孩子到正规医院妇科就诊，进行相关检查，如性激素六项、B 超等，以明确原因，并在医生的指导下进行治疗。

考虑青春期月经失调，可以看中医调理，一般情况随着年龄增长自然规律提问者对于答案的评价：