孩子反复发烧伴喉咙痛且查出表皮葡萄球菌，可能是感染未控制、免疫力低、治疗不彻底、再次感染、合并其他病原体感染等原因导致。 1. 感染未控制：表皮葡萄球菌可能对之前使用的药物不敏感，需要根据药敏试验调整用药。 2. 免疫力低：孩子自身免疫力较弱，难以有效抵御病原体，可适当补充维生素、微量元素，增强体质。 3. 治疗不彻底：有时症状缓解但病菌未完全清除，需按疗程规范治疗。 4. 再次感染：孩子接触到新的病原体，要注意环境卫生和个人卫生。 5. 合并其他病原体感染：可能同时有病毒或其他细菌感染，需进一步检查明确。 总之，对于孩子的这种情况，家长要密切关注孩子的症状，遵医嘱进行治疗和护理。让孩子多休息，多喝水，饮食清淡易消化。相信经过科学合理的治疗，孩子会逐渐恢复健康。

多数皮肤感染可适当选用口服抗生素如氯唑西林、双氯西林或红霉素。更严重的感染特别血行感染需要静脉注射抗生素治疗，通常要求疗程达到6周。　　抗生素的选择有赖于感染的部位、疾病的严重性和最能有效杀死这种细菌的抗生素。耐甲氧西林金黄色葡萄球菌能对常用的抗生素耐药，应给予特别注意，因为在大城市和众多医院内这种菌正在成为常见菌种，用以治疗耐甲氧西林金黄色葡萄球菌的抗生素为数不多，通常有效的为万古霉素和复方磺胺甲基异唑；万古霉素杀死这种细菌而复方磺胺甲基异唑具有抑制这种细菌繁殖的作用。　　如已形成脓肿必须要引流。在皮肤上引流脓肿相对较简单，医生在脓肿处切一小口并使用压力清除感染的物质。脓肿在身体较深的部位则需要外科手术处理。