妻子胚胎停止发育，丈夫染色体为 46.XY 可能是正常的，但也不能完全排除潜在问题。导致胚胎停育的原因众多，如胚胎自身异常、母体因素、环境因素、免疫因素、内分泌因素等。 1. 胚胎自身异常：胚胎染色体异常是常见原因，可能在受精或发育过程中发生突变。 2. 母体因素：包括子宫畸形、全身性疾病、内分泌失调（如黄体功能不全、甲状腺功能异常）、生殖系统感染等。 3. 环境因素：接触有毒有害物质（如化学毒物、放射性物质）、高温、噪音等环境。 4. 免疫因素：自身免疫性疾病或同种免疫异常，影响胚胎发育。 5. 内分泌因素：多囊卵巢综合征、高泌乳素血症等导致激素失衡。 6. 其他因素：不良生活习惯（如吸烟、酗酒、熬夜）、精神压力过大等也可能有影响。 胚胎停止发育是一个复杂的问题，需要综合多方面因素进行分析。如果出现这种情况，建议夫妻双方及时到正规医院的妇产科或生殖医学科进行全面检查，以明确原因，为下次妊娠做好准备。

男性染色体是46.XY，女性是46.XX.只是这种检查结果不能说明胚胎停止发育的原因。如果怀疑基因异常引起的，应当再查一查染色体有没有什么缺陷。