病因不明。在毛囊周围有淋巴细胞浸润，且本病有时合并其他自身免疫性疾病（如白癜风、特应性皮炎），故目前认为本病的发生可能存在自身免疫的发病机制。遗传素质也是一个重要因素，可能与HLAⅡ型相关，25%的病例有家族史。此外，还可能和神经创伤、精神异常、感染病灶和内分泌失调有关。

引发斑秃的原因很多，其中主要包括意下几点：　　(1)精神因素：大多数学者认为，斑秃是由于忧虑或精神刺激、环境的变化所致。　　(2)神经因素：由于植物神经或中枢神经障碍所致。斑秃可在脑震荡、外伤后发生或加重。有学者研究发现，斑秃患者的脑电图异常率特别高。另据观察，有80%斑秃患者有脑血流图异常，头皮局部供血不良，可能是由于患者精神紧张，导致植物神经功能紊乱，交感神经紧张性增高，毛细血管持续性收缩，造成毛根部血液循环障碍，毛根种子层的细胞功能减退而发病。　　(3)内分泌异常：甲状腺疾患合并斑秃者特别多，其中与甲状腺功能亢进的关系更为密切。妇女在妊娠时，斑秃往往会自愈，但在分娩后脱发又可复发，估计这与激素有关。　　(4)遗传：有斑秃家庭史者约占10%~20%，除母女同患外，还可能发生在双胞胎。

长期的吸烟，会让男性朋友们更快的出现秃顶脱发的现象，据一项研究调查发现，在吸烟的人群中，有脱发严重现象的患者，其比例远远的高于正常人群，并且其症状一般较为严重。研究人员指出，长期的吸烟可能损伤了发根的毛囊，影响了头发的生长。精神因素也会激发斑秃的症状。斑秃的出现与患者的精神状态有极大的关系。当患者处于负面情绪时，机体进入了紧周的状态，从而导致心理和生理方面的应激反应，导致体内的神经功能紊乱，引起了各种生理病理的变化，毛细血管开始收缩，血管的密度减少。容易导致血管栓塞等等。由于剧烈的精神刺激而引起的神经反应，会进而导致一系列的生理病理改变，其在每个人的身上表现都有所差异。每个人的神经类型以及性格都有很大的不同，对负面刺激的反应和承受能力也会有很大的差异，因此，部分人群出现斑秃症状，而部分人群则不会脱发。