跑步时突然两侧太阳穴阵痛，可能是以下原因：血压异常、血管性头痛、神经紧张、颈椎问题、低血糖。 1.血压异常：跑步时血压可能会发生波动，高血压或低血压都可能引起头痛。如果是高血压，需要遵医嘱使用降压药，如硝苯地平、氨氯地平、缬沙坦等，并注意低盐饮食、适量运动、保持心情舒畅。 2.血管性头痛：跑步可能导致血管扩张或收缩异常，引发头痛。治疗常使用非甾体抗炎药，如布洛芬、对乙酰氨基酚等，缓解疼痛。 3.神经紧张：快跑时精神高度集中，神经紧张可能导致头痛。要注意放松心情，保证充足睡眠，必要时可咨询心理医生。 4.颈椎问题：长期不良姿势可能导致颈椎病变，跑步时影响神经和血管，引起头痛。可通过按摩、热敷等缓解，严重时需就医治疗。 5.低血糖：跑步消耗能量，血糖降低可能引发头痛。及时补充糖分，如吃糖果、喝糖水等。 总之，跑步时突然两侧太阳穴阵痛的原因较多。如果频繁出现这种情况，建议及时到医院神经内科就诊，进行相关检查，以明确病因，采取针对性治疗。

你描述的症状是脑血管痉挛导致的。一般剧烈运动会导致血液流速加快，这个时间就会导致脑血管刺激症状出现脑血管痉挛性头痛的表现，建议你可以从慢跑开始，要有一个适应的过程。

引起头痛的原因很多，如偏头痛，血管神经性头痛，三叉神经痛，枕大神经痛，，脑血管病，颈椎病，中耳炎，饮酒和吸烟，感冒都可能诱发。所以要找到原因指导下的治疗。平常注意防止精神紧张保证休息时间和质量，戒烟酒。防止受凉感冒等诱因。