生宝宝时查出妈妈和宝宝有梅毒但爸爸没有，可能有以下几种原因：性接触频率、感染时间差异、个人免疫力、检验误差、特殊感染途径。 1.性接触频率：梅毒主要通过性接触传播。若妈妈与爸爸性接触次数少，爸爸感染的几率相对较低。 2.感染时间差异：妈妈感染梅毒时间可能较长，在孕期传给宝宝。而爸爸可能在妈妈感染后还未被传染。 3.个人免疫力：每个人的免疫力不同。爸爸免疫力较强，可能成功抵御了梅毒螺旋体的侵袭。 4.检验误差：检测过程中可能存在失误，导致爸爸的检测结果不准确。 5.特殊感染途径：妈妈可能通过输血、共用注射器等特殊途径感染，而爸爸未经历这些。 总之，出现这种情况的原因较为复杂。建议妈妈和宝宝尽快到正规医院接受规范治疗，爸爸也应定期复查，以防万一。

梅毒治疗应该注意，梅毒诊断必须明确，治疗越早效果越好，一般是青霉素治疗.剂量必须足够，疗程必须规则．治疗后要追踪观察。应对传染源及性侣或性接触者同时进行检查和梅毒治疗治疗。