克罗恩病是一种慢性肠道炎症性疾病，病因尚不明确，可能与遗传、免疫、感染等因素有关。对于 15 岁患者治疗三个月后小腹疼痛加重的情况，可从调整治疗方案、加强护理、注意饮食、缓解心理压力以及寻求更专业的医疗帮助等方面来处理。 1. 调整治疗方案：评估当前所用药物的效果，如美沙拉嗪、硫唑嘌呤、英夫利昔单抗等，必要时更换或联合用药。 2. 加强护理：注意休息，避免剧烈运动，保证充足睡眠。 3. 注意饮食：遵循少渣、无刺激、高热量、高营养的原则，避免食用辛辣、油腻、生冷食物。 4. 缓解心理压力：通过心理疏导，让患者保持积极乐观的心态，有助于病情恢复。 5. 寻求更专业的医疗帮助：可以考虑前往大型综合性医院的消化内科，咨询专家意见。 总之，克罗恩病的治疗需要综合考虑多种因素，患者和家属应积极配合医生，共同制定适合的治疗方案，以减轻疼痛，控制病情。

这种情况目前是属于医学比较难的胃肠疾病主要是肠道的免疫功能下降引起的建议及时去医院详细看看医生会结合具体情况进行治疗，祝你健康。