先天性右侧膈疝患儿肺炎反复且巨细胞过高，可能与患儿自身免疫功能、膈疝术后恢复、环境因素、治疗不彻底、护理不当等有关。 1. 自身免疫功能：先天性膈疝患儿本身免疫功能可能较弱，易受病原体侵袭。可通过均衡营养、适当锻炼增强免疫力。 2. 膈疝术后恢复：术后身体尚未完全恢复，呼吸系统功能可能受到一定影响，增加肺炎发生风险。需要密切关注恢复情况，定期复查。 3. 环境因素：生活环境中的细菌、病毒等病原体较多，或空气质量差，容易引发肺炎。要保持室内清洁通风。 4. 治疗不彻底：肺炎治疗时，若未按疗程用药，病原体可能未被完全清除，导致病情反复。应严格遵医嘱完成治疗。 5. 护理不当：如喂养不当导致吐奶，易引起呛咳，增加肺部感染机会。要注意正确的喂养姿势和方法。 总之，对于先天性右侧膈疝患儿出现的肺炎反复和巨细胞过高的情况，需要综合考虑多方面因素，积极治疗，加强护理，以促进患儿康复。

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孩子如果是膈疝是会导致呼吸困难的可能的，至于你说合并肺炎巨细胞病毒感染等情况是需要去医院结合转氨酶检查明确是否异常的，合并肺炎是需要结合抗生素药物输液的所以针对你目前说的症状是需要结合抗生素药物输液治疗的，再就是需要结合雾化吸入治疗的，再就是需要结合氨溴索化痰等治疗的，巨细胞增高是需要结合更昔洛韦等进行抗病毒治疗的

先天性的膈疝要加强对症的抗炎的治疗，同时行手术的治疗后加强密切的观察，定期的复查，积极的抗炎。

那只有手术治疗。