病变区清创，除去病原微生物促进药物穿入且用于取材实验室检查，清创后溃疡面用5%碘酊烧灼或涂1%甲紫后生埋盐水冲洗每日一次，连续3～5天。　　抗阿米巴药物，原则上联合用药冲击治疗　　双胍类阳离子消毒剂为首选药。洗必泰能络合棘阿米巴细胞内磷分子如ATP、核酸阻断DNA功能；吸附细胞膜的磷分子致胞质漏出，改变包囊壁渗透性，破坏孔膜完整性促药物通透，洗必泰体外药物实验可迅速使棘阿米巴失活。　　另为0.02%聚六亚甲双胍（PHMB）其平均最小杀滋养体包囊浓度同洗必泰，目前已公认以上两种眼药水是治疗本病的最适宜药物。　　芳香二脒类：0.1%羟乙磺酸丙氧苯脒滴眼液　　0.2%甲硝唑葡萄糖滴眼液，0.4%替硝唑滴眼液对棘阿米巴也有一定的杀灭作用　　氨基糖苷类：0.5%～1%新霉素，1%巴龙霉毒能作用于滋养体胞膜改变其通透性，对包囊作用差　　咪唑类：文献报道0.2%伊曲康唑滴眼液，1%克霉唑，0.2%氟康唑等作用，仅作为支持疗法，临床疗效尚待验证。　　0.2%洗必泰或0.02%PHMB联合0.2%甲硝唑，或者0.4%替硝唑及0.5%～1%新霉素滴眼液每1/2～1小时频繁滴眼冲击治疗。5-7日后依病情逐渐减滴药次数，由于原虫可移行造基质层，包囊存活较久，炎症退行后仍需长时间局部用药随诊，总诊程不少于6个月。急性炎症时除局部用药外可服用甲硝唑或静点甲硝唑，必要时结膜下注射0.2%-0.5%甲硝唑或口服伊曲康唑。　　抗炎药物：吲哚美辛可缓解症状，实践证明地塞米松处理滋养体可活化虫体促其增生，促包囊出囊，增强其致病性，在原虫感染未控制之前严禁使用激素。　　扩瞳：阿托品治疗虹睫炎，降眼压醋氮酰胺　　手术：急性炎症期应首先以药物控制感染，安静眼手术效果优于炎症眼，如药物治疗不能有效控制感染，病变面积继续扩大或溃疡达基质深层行将穿孔时，应在药物治疗基础上行治疗性角膜移植，根据病变范围、深度决定穿透性或板层角膜移植，本病角膜移植的常见原因是残留的棘阿米巴活化感染复发和植后排斥反应，术后继续口服抗阿米巴药物，随诊半年以上。

治疗　　1.药物治疗目前常用的药物有如下几类：　　(1)阳离子防腐剂：体外试验表明阳离子防腐剂有很强的杀灭棘阿米巴滋养体及其包囊的作用，其作用机制是干扰了膜的功能。临床上无论是作为首选用药，还是在其他药物治疗失败的情况下，都显示了良好的疗效。目前常用的是0.02%的氯已定(chlorhexidine)和0.02%的聚六甲基双胍(polyhexamethylbiguanidePHMB)，对角膜上皮没有明显的毒性作用。　　(2)芳香族双脒：芳香族双脒(Aromaticdiamidines)类药物可以抑制棘阿米巴DNA的合成，对滋养体和包囊均有效。这类药物是应用最早的、能有效控制阿米巴角膜炎的药物，与阳离子防腐剂具有协同作用。阳离子防腐剂能够破坏膜的功能，有利于芳香族双脒类药物进入虫体发挥作用。二者联合使用，是目前最常用的治疗方案。常用的有0.1%普罗帕脒，0.15%依西双溴丙脒。但长时间应用对角膜组织可产生药物毒性反应。体外试验证实，二甲基亚砜可增加药物对包囊的穿透性，明显加强普罗帕脒的杀灭包囊的作用。　　(3)氨基糖苷类抗生素：巴龙霉素和新霉素与芳香族双脒类药物合用，可进一步提高疗效。新霉素具有类似洗必泰和PHMB的作用，可以破坏棘阿米巴的外膜，促进芳香族双脒类药物进入虫体发挥作用，但对包囊无效。应用过程中也应注意其毒性作用，避免长期使用。　　(4)咪唑类：咪唑类可以影响棘阿米巴细胞壁的稳定性，在治疗过程中起到辅助作用，单独用药往往无效。药物主要包括克霉唑、氟康唑、酮康唑、伊曲康唑和咪康唑等。　　(5)糖皮质激素：在抗棘阿米巴治疗的同时，是否应用糖皮质激素，目前尚有争议。在体外试验中，糖皮质激素能够抑制棘阿米巴的包囊形成和脱囊过程，有利于角膜炎的治疗。但在动物试验中，此过程没有得到证实，相反，应用糖皮质激素可加重角膜的浸润和基质中胶原组织的坏死。因此，除非合并有巩膜炎或葡萄膜炎，对于糖皮质激素的使用应该慎重。　　药物治疗应采用联合用药的方式