肠系膜动脉栓塞的治疗方法首先是保守性的治疗，通常在病人出现腹部疼痛八个小时之内的，而且没有腹膜刺激症状的病人者一般进行保守性的治疗，通常进行抗凝和溶栓的治疗，其次是解痉和扩张血管。还要调整人体的水电解质的紊乱，进行抗感染的治疗。病人还要注意禁止进食。

应迅速去除血管内的栓子，恢复肠系膜上动脉的血液灌注。对急性肠系膜上动脉栓塞患者早期应补足血容量，积极纠正存在的酸中毒，选用合适的抗生素及安置胃管等手术治疗无论何种原因造成的急性肠系膜上动脉栓塞，大部分患者均需要急诊手术剖腹探查，重建肠系膜上动脉血供，以防止或减少肠坏死。

肠系膜动脉栓塞，一般是来自于心脏瓣膜或者是下肢静脉血栓等等引起的肠系膜动脉栓塞会到剧烈的腹痛表现，在发病初期，可以考虑进行溶栓以及抗凝治疗效果比较好的，严重的就需要进行手术处理了

本病多发于患有动脉粥样硬化、心脏瓣膜病脓毒血症的患者，怀疑本病时可做肠系膜动脉造影，一旦确诊应积极治疗确诊本病后尝试溶栓治疗若疗效欠佳应早行开腹手术探查去除栓子术后继续应用用药物抗凝治疗如有肠管坏死需行肠切除术。