膝盖软组织损伤后长时间疼痛，又再次扭伤，可能与损伤未完全恢复、康复不当、新的损伤、炎症反应、关节结构改变等有关。 1. 损伤未完全恢复：软组织损伤有时恢复较慢，如果损伤较重或治疗不彻底，可能导致症状持续存在。 2. 康复不当：伤后没有进行科学的康复训练，肌肉力量和关节灵活性不足，容易再次受伤。 3. 新的损伤：此次扭伤可能造成了新的软组织损伤，加重了疼痛。 4. 炎症反应：损伤部位可能存在慢性炎症，扭伤会使炎症加重。 5. 关节结构改变：长期损伤可能导致关节结构发生变化，影响关节稳定性。 总之，这种情况需要重视。建议及时就医，进行详细的检查，如 X 光、磁共振成像（MRI）等，以明确损伤的具体情况。治疗上，可采取休息、冷敷、热敷、物理治疗、药物治疗等方法。药物可选择布洛芬、双氯芬酸钠、塞来昔布等，缓解疼痛和炎症，但需遵医嘱使用。同时，要注意休息，避免过度活动，加强膝关节周围肌肉的锻炼，促进恢复。

请到医院骨科检查，排除腘窝囊肿的可能，同时做膝关节核磁共振成像，排除半月板损伤和韧带损伤的可能，明确诊断后对症治疗