右肩膀骨头腋下附近久坐后疼痛持续三个月，可能是肌肉劳损、肩周炎、颈椎病、肩部筋膜炎、肩关节脱位等原因引起。 1.肌肉劳损：长时间保持一个姿势，肩部肌肉持续紧张，容易导致劳损，产生疼痛。可通过热敷、按摩、休息来缓解。 2.肩周炎：肩部关节周围组织的炎症，表现为肩部疼痛和活动受限。治疗包括物理治疗、药物治疗，如布洛芬、双氯芬酸钠等。 3.颈椎病：颈椎病变可能压迫神经，引起肩部放射性疼痛。需改善坐姿，必要时进行牵引治疗。 4.肩部筋膜炎：筋膜的无菌性炎症，受寒、劳累等可诱发。可服用美洛昔康、塞来昔布等药物。 5.肩关节脱位：多有外伤史，表现为肩部疼痛、活动障碍。需及时复位治疗。 出现右肩部疼痛应引起重视，避免长时间久坐和过度劳累。如疼痛持续不缓解或加重，应及时到正规医院就诊，明确病因，进行针对性治疗。

您的情况应该是感受了风湿邪气或者是累着了导致肌肉劳损的问题。1、请中医大夫看看，请医生对您的身体进行明确的辩证后选用中药来调治。可考虑选用独活寄生汤、归脾汤等加减调治。2、可考虑去医院检查一下风湿系列及肩部的X线片，以明确诊断指导治疗。