三个月宝宝有蚕豆病且脸黄，可能是胆红素代谢异常、贫血、母乳性黄疸、蚕豆病发作、肝功能异常等原因所致。 1.胆红素代谢异常：宝宝的胆红素代谢功能可能尚未完善，导致胆红素在体内积聚，引起皮肤发黄。 2.贫血：蚕豆病可能导致红细胞破坏增加，引发贫血，使脸色看起来发黄。 3.母乳性黄疸：虽然纯母乳喂养，但仍可能出现母乳性黄疸，导致皮肤发黄。 4.蚕豆病发作：某些诱因可能引发蚕豆病发作，影响红细胞，导致胆红素升高，出现脸黄。 5.肝功能异常：母亲有乙肝大三阳，宝宝可能存在肝功能异常，影响胆红素代谢。 总之，宝宝脸黄的原因较为复杂。建议及时带宝宝到正规医院就诊，进行相关检查，如血常规、肝功能、胆红素测定等，以明确原因，并采取相应的治疗措施。

建议您及时去正规医院化验孩子的肝功能等等检查，排除有母乳性黄疸或者溶血性黄疸引起的这种情况要及时检查排除孩子感染乙肝的可能，要及时去正规医院检查对症治疗，必要的情况下需要及时停止哺乳。一般情况下生后三个月黄疸还是母乳性黄疸的可能性大一些