女儿患轻微手足口病，痘痘消失但仍反复发烧、咳嗽，可能是病毒未清除、合并细菌感染、免疫反应、呼吸道刺激、病情进展等原因所致。 1. 病毒未清除：手足口病病毒可能仍在体内活跃，导致症状持续。此时需要继续抗病毒治疗，如使用利巴韦林、阿昔洛韦等。 2. 合并细菌感染：可能合并了细菌感染，引发炎症。需进行血常规检查，若白细胞升高，可使用抗生素，如头孢克洛、阿莫西林等。 3. 免疫反应：孩子自身免疫系统对病毒的反应，也会出现发热咳嗽。要注意休息，加强营养支持。 4. 呼吸道刺激：周围环境中的过敏原、灰尘等刺激呼吸道，加重咳嗽。保持室内清洁，通风良好。 5. 病情进展：手足口病可能有新的发展，影响到呼吸道。密切观察病情，必要时完善相关检查。 总之，对于孩子的这种情况，家长要密切观察，让孩子多休息、多喝水。如果症状持续不缓解或加重，应及时带孩子到正规医院就诊。

你好，手足口病一般发生在5岁以下，属于病毒感染，有自限性的，一般两周就好的。这个情况可能合并有支原体感染的情况，可以详细检查一下，排除别的肺炎。