碘酒和酒精在成分、消毒能力、刺激性、适用范围、化学原理方面存在不同。 1.成分：碘酒是碘和碘化钾的酒精溶液，碘是主要的杀菌成分，碘化钾可增加碘的溶解度；酒精主要成分就是乙醇，常见的是75%的乙醇溶液。 2.消毒能力：碘酒消毒能力较强，可杀灭细菌芽孢、真菌、病毒等多种微生物；酒精能杀灭细菌繁殖体、部分真菌和病毒等，但对芽孢的杀灭能力较弱。 3.刺激性：碘酒对皮肤黏膜刺激性较大；酒精相对碘酒刺激性小一些，但也有一定刺激性。 4.适用范围：碘酒常用于皮肤消毒，尤其是术前皮肤消毒；酒精除了皮肤消毒，还可用于医疗器械的消毒等。 5.化学原理：碘酒中碘元素具有强氧化性，能使细菌蛋白质变性而起到杀菌作用；酒精能使细菌蛋白质脱水、凝固变性，从而达到消毒目的。 碘酒和酒精在多方面存在差异，二者化学原理不同，在医疗中都有重要的消毒用途，应根据具体情况合理选用。

碘酒是高效消毒剂，酒精是中效消毒剂，消毒的范围和效果是不同的。还有一样是酒精有很强的刺激性，很多人的会造成皮肤发红，如果做皮试会皮肤发红，造成结果的误差。

酒精的消毒杀菌原理是由于酒精能使菌体蛋白质脱水。凝固、变性，进而杀死细菌。碘酒是碘和碘化钾的酒精溶液，碘酒中的碘元素可直接卤化菌体蛋白质，使蛋白质变性沉淀，进而杀灭细菌，其杀菌作用强而快，2％碘酒互分钟可杀灭各种细菌、霉菌和细菌芽胞。所以碘酒的消毒效果好于酒精，但碘酒对皮肤和粘膜的刺激性大，可损伤皮肤和粘膜，用后要马上用酒精脱碘。另外要注意碘酒不能与红药水同用，因碘酒中的碘与红药水中的汞，可发生化学反应生成碘化高汞，碘化高汞有毒性，对人体有伤害作用。