阴茎包皮上长小疙瘩且痛，可能由多种原因引起，如包皮龟头炎、皮脂腺异位症、生殖器疱疹、尖锐湿疣、珍珠状阴茎丘疹等。 1. 包皮龟头炎：多因包皮过长、不注意清洁等导致细菌、真菌等感染。症状包括红肿、疼痛、分泌物增多等。治疗常使用克霉唑乳膏、莫匹罗星软膏等。 2. 皮脂腺异位症：一般无明显症状，若有疼痛可能合并感染。通常无需特殊治疗，注意局部卫生。 3. 生殖器疱疹：由单纯疱疹病毒感染引起，表现为簇集性水疱，伴有疼痛。可使用阿昔洛韦乳膏、伐昔洛韦片等治疗。 4. 尖锐湿疣：由人乳头瘤病毒感染所致，初期为小丘疹，逐渐增大增多。治疗方法有激光、冷冻、外用咪喹莫特乳膏等。 5. 珍珠状阴茎丘疹：多为生理变异，一般无自觉症状，若有疼痛可能因摩擦或感染。通常无需治疗，注意观察即可。 当发现阴茎包皮上有小疙瘩且疼痛时，应避免搔抓和自行用药，及时到正规医院就诊，明确病因后进行针对性治疗。

龟头上有小红点是典型的包皮龟头炎的症状，建议你及早去医院检查确诊，对症治疗。早日康复。