慢性乙肝在全身各个系统均可发生并发症，常见的有：　　（1）肝源性糖尿病：肝源性糖尿病有两型，第一型是胰岛素依赖型，是由于慢性乙肝损害了胰岛β细胞，导致胰岛素分泌减少，要靠补充胰岛素治疗。第二型是非胰岛素依赖型，是肝脏对胰岛素降糖的生理作用降低，以致胰岛素不能充分发挥作用。　　（2）脂肪肝：慢性乙肝易继发脂肪肝，常在肝炎后发胖，血清谷丙转氨酶（ALT）中度升高、血脂升高，肝脏B超检查呈脂肪肝波型。主要是由于进入肝脏的脂肪酸和糖增多、肝脏合成脂肪酸增加或氧化减少所至。　　（3）慢性乙肝后高胆红素血症：此指慢性乙肝后部分病人遗留轻度黄疸，黄疸持久不退，中西药治疗效果欠佳，肝功能大多正常。

乙肝病毒长期存在体内，不断损害肝脏　　乙肝病毒慢性感染过程中机体需要反复清除乙肝病毒，如此可持续数年至数十年。由于免疫功能低，病毒无法清除，肝组织反复受损，反复修复，肝脏产生不同程度的纤维化。B超检查和组织学检查，则可清楚见到肝脏有明显的纤维化改变。如果治疗不及时，不能有效治疗纤维化，则转化为再生结节，形成假小叶，约20%左右的人出现肝硬化。　　危害二、病程发展可至肝硬化、肝癌，危及生命　　慢性乙肝在初期尽管对肝脏有损害但可以没有明显症状，因而导致很多人没有发现自己患有慢性乙肝疾病。由于肝脏代偿能力逐渐变差，一旦出现肝炎活动，就极易出现黄疸、腹水、出血、昏迷、尿少等严重后果。乙肝病毒携带者中，50%~75%的人有活动性病毒复制的慢性乙肝，估计5年中从慢性乙肝进展为肝硬化的发生率为2%~20%；从代偿性肝硬化到肝脏失代偿为20%~23%；从代偿性肝硬化到肝癌为6%~15%。