晨起阴茎勃起时尿尿疼，可能由尿道炎、前列腺炎、尿路结石、阴茎损伤、泌尿系统感染等引起。当身体出现异常时，应赶紧就医，听从医生的指导进行诊治，不宜擅自用药。
1.尿道炎：多因细菌感染，炎症刺激尿道导致疼痛。可使用左氧氟沙星、头孢呋辛酯、阿莫西林等药物治疗。
2.前列腺炎：前列腺发炎会影响排尿。常用药有坦索罗辛、多沙唑嗪、环丙沙星等。
3.尿路结石：结石刺激尿路黏膜引发疼痛。治疗可能包括排石颗粒、枸橼酸钾等药物，或体外碎石。
4.阴茎损伤：外伤导致阴茎组织受损。需休息，严重时就医。
5.泌尿系统感染：细菌侵入泌尿系统。可选用磺胺嘧啶、呋喃妥因等。
出现这种情况应重视，及时就医明确病因，遵医嘱治疗，同时注意个人卫生，多喝水。

这种情况考虑可能泌尿系炎症引起，建议你到正规的医院进行检查,化验尿常规检查,可以服用左氧氟沙星,甲硝唑和三金片治疗，除药物治疗外,多喝水,保持每天尿量在两千毫升以上,这样起到尿路冲洗的作用,忌辛辣刺激性食物.