碱性磷酸酶病理性升高主要见于下面几种情况：1.骨骼疾病如佝偻病、软骨病、骨恶性肿瘤、恶性肿瘤骨转移、白血病等2.肝胆疾病如肝外胆道阻塞、肝癌、肝硬化、毛细胆管性肝炎等3.其他疾病如甲状旁腺机能亢进应该说，以前给您的孩子看病的医生基本上考虑到了各种常见的原因，所做的检查也是对其推断的合理验证。比如，血常规正常基本排除了白血病；肝胆胰B超说明肝脏没发现问题（如果结合血生化和肝功能检查就更有说服力了）；膝关节X光片正常说明骨肿瘤的可能性小（骨肿瘤好发于膝关节）；其他乙肝检查等说明没有肝炎；这么小的孩子基本可以排除肝硬化、肝癌等目前，不知道有没有做过血生化和肝功能检测？主要看下孩子血胆红素有没有升高，肝功是否正常。骨骼病变仍不能完全排除，建议继续追踪检查。因为病情不明朗，建议去上海的大医院继续诊治（不是北京的不好，恐怕太难排队，上海毕竟离您居住地较近，稍微方便些）祝孩子早日恢复健康

骨碱性磷酸酶高，骨形成活跃有关，可服用鱼肝油及钙剂看看。

根据你提供的情况，很可能是罕见病种，遗传代谢方面的疾病可能性比较大，如果家中经济允许，建议早点去大医院诊疗，最好去北京儿童医院。