治疗利福平加乙硫异烟胺和乙胺丁醇的联合治疗有满意疗效。推荐方案是：1.对本菌引起的感染，用利福平加乙胺丁醇治疗2个月后减少用药剂量,乙硫异烟胺和维生素B6共四种药，治疗18个月。2.由于利福平显著增加药物代谢，在应用HIV蛋白酶抑制剂时，不能同时用利福平，可用低剂量利福喷汀。3.伴严重感染时，如空洞或播散性感染，可先用氨基糖苷类抗生素，如给予链霉素每周治疗3～5天，直到痰培养阴性。4.对儿童淋巴结炎，推荐切除所有可触及的淋巴结，并配合药物治疗。

本病主要在温带地区流行。随着人类免疫缺陷病毒的流行，在HIV感染者中发病报道有增加，目前本病在艾滋病患者的常见分枝杆菌感染中占第二位。

NTM对于人类致病的潜能不尽相同。总体来说，作为一个类别，对于人类的致病毒性不像结核分枝杆菌那么强烈，可以移生于人体表面和分泌物，不致引起疾病。组织侵袭一般是事出有因，即发生在已有局部或系统性防御机能障碍的宿主。堪萨斯分枝菌侵入受伤的皮肤伤口，可发生局限性皮损，主要引起肺部感染。患病者最好住院观察治疗，一般是可以康复的。