新生儿眼睛出现黑斑可能是多种原因，如色素沉着、先天性眼部疾病等。常见的有结膜色素痣、巩膜色素斑、太田痣等。药物治疗需谨慎，身体出现不适时，应首先寻求医生的意见，避免盲目用药。
1.结膜色素痣：是由色素细胞聚集形成，一般为良性，无明显症状可不处理。
2.巩膜色素斑：多因巩膜较薄，透见深层脉络膜的色素，通常无需治疗。
3.太田痣：常位于眼周，可随年龄增长而扩大，目前主要通过激光治疗。
4.其他原因：如眼部炎症后的色素沉着，需治疗原发病。
5.就医检查：若黑斑有变化或影响外观，应及时到正规医院眼科就诊，进行详细检查。
总之，新生儿眼部出现黑斑需密切观察，必要时就医，以确定具体情况和采取合适措施。

很可能是太田痣也就是常说的黑胎记或者青胎记。治疗的早的话是可以被去除的，鉴于您女儿刚出生，又是在眼部所以建议用色素提取消融法，安全可靠。

胎记在医学上称为“母斑”或“痣”，是皮肤组织在发育时异常的增生，在皮肤表面出现形状和颜色的异常。胎记可以在出生时发现，也可能在初生几个月后才慢慢浮现。眼睛里的胎记，不能接受手术，等传统疗法，可能会留有疤痕，胎记越早治疗效果越好，为了避免留下疤痕，最好采用SDT-色素分离消融技术，目前治疗胎记的最好方法。

巩膜上的这种黑斑一般是无法去除的，很可能会终生存在。如果是在皮肤上，还可以考虑激光治疗，但在眼睛上，那就没有什么好办法了，总不能因为美观而影响眼睛的功能吧？