乙肝两对半检查异常后还需要配合其他检查来确认治疗方式，比如病毒是否阳性(即HBV-DNA是否阳性)、肝功是否正常、肝脏影像检查是否有肝纤维化甚至肝硬化征像。乙型病毒性肝炎尚缺乏特效治疗，一般临床上能够达到持续病毒学应答且HBsAg阴转或伴有抗-HBs阳转、ALT正常、肝组织学轻微或无病变就算治愈了，如无法获得停药后持续应答，抗病毒治疗期间长期维持病毒学应答(HBV DNA检测不到或是持续在一个极低水平内)也算是一个比较理想的治疗结果。想要完全清除乙肝病毒DNA是不太现实的。治疗主要是抗病毒、免疫调节、抗炎保肝、抗纤维化和对症治疗，乙型肝炎病毒复制明显的病人用抗病毒药物，有免疫功能紊乱的用调整免疫功能的药物，有肝细胞损伤的用保护肝细胞的药物，有肝脏微循环障碍的用活跃微循环的药物。只要有适应证且条件允许，就应行规范抗病毒治疗。乙型病毒性肝炎病人用药宜简不宜繁，选择抗病毒治疗方案时应重视个体化治疗。