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顾兵教授团队联合研发新冠变异株快速分型的核酸检测技术

2022-03-24 18:02:38      

2022年3月16日,广东省人民医院检验科顾兵教授团队联合华南理工大学张雷教授团队在中科院1区感染领域权威杂志Emerging Microbes & Infections发表了题为“RT-LAMP assay for rapid detection of the R203M mutation in SARS-CoV-2 Delta variant”的论文(doi:10.1080/22221751.2022.2054368)。

本研究开发了一种基于RT-LAMP鉴定单碱基突变水平的检测方法,针对SARS-CoV-2N基因的保守区域、Delta特异突变R203M区域设计了2对特异性引物(conserved primer set 和R203 primer set),在CqR203M/ Cq conserved阈值为1.80时,可实现新冠病毒Delta突变株及野生株的快速检测及区分,并进行了临床验证,分型准确率达到100%。


图1.RT-LAMP法对新冠Delta典型突变位点检测方法的建立

该方法实现1小时左右对Delta变异株的鉴定和SARS-CoV-2感染的实时监测,常规的荧光定量PCR检测平台即可开展,有望为COVID-19可疑患者的快速分流及Delta株的精准分型提供有力手段。


图2.Cq-ratio based RT-LAMP技术对新冠临床样本的检测和分型

顾兵教授和李杉教授为论文的共同通讯作者,杨佳宁和胡雪姣博士为共同第一作者,该项研究得到国家自然科学基金(82072380, 81871734, 82002236)、国家药监局血液制品质量控制重点实验室(KF2021009)、国家重点研发项目(2017YFC160120,2018ZX09201-02)的支持。

(责任编辑:梁旭恒 通讯员:郝黎、张蓝溪、靳婷 文:胡雪姣 图:赵云虎 审阅:顾兵)

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