小便疼痛发展为射精疼痛且龟头流脓，可能与尿道炎、前列腺炎、精囊炎、性传播疾病、尿路结石等因素有关。健康无小事，身体不适切莫忽视。及时就医，根据医生指导进行治疗，早日恢复健康。
1.尿道炎：多由细菌感染引起，表现为尿频、尿急、尿痛，严重时可出现脓性分泌物。治疗常使用头孢曲松、左氧氟沙星等抗生素。
2.前列腺炎：可由病原体感染或不良生活习惯导致。会有下腹疼痛、排尿异常等症状。治疗包括使用抗生素如环丙沙星，以及非甾体抗炎药如塞来昔布。
3.精囊炎：多因逆行感染所致。常有血精、射精疼痛等。治疗可选择头孢呋辛酯、阿奇霉素等药物。
4.性传播疾病：如淋病，由淋病奈瑟菌感染引起。主要症状为尿道口红肿、脓性分泌物等。治疗用大观霉素、头孢噻肟等。
5.尿路结石：结石刺激尿路可引起疼痛和炎症，导致相关症状。小结石可通过多喝水排出，大结石可能需手术治疗。
出现上述症状应及时就医，进行相关检查，明确病因后遵医嘱治疗。

您好，射精疼痛并且有脓液的话要考虑局部炎症，并且高度怀疑是细菌感染，建议尽快到当地正规医院专科就诊，在医生指导下进行规范的诊疗以免耽误病情。希望我的回答对你有所帮助。