：(1)慢性肠道细菌感染性疾病：如慢性细菌性痢疾、溃疡型肠结核、沙门氏菌感染、肠道菌群失调。 (2)肠寄生虫病：如慢性阿米巴痢疾、慢性血吸虫病、肠鞭毛虫病、结肠小袋纤毛虫病、肠道蠕虫病等。 (3)非细菌性炎症：如克降氏病、慢性非特异性溃疡性肠炎、结肠憩室炎、结肠息肉并发结肠炎等。 (4)肠肿瘤：如结肠癌、直肠癌、小肠恶性淋巴瘤。 (5)胃原性慢性腹泻：如慢性萎缩性胃炎、胃癌晚期、胃空肠吻合术后。 (6)胰原性慢性腹泻：如慢性胰腺炎、胰腺癌晚期。 (7)肝、胆道疾病所致慢性腹泻。 (8)内分泌、代谢障碍疾病：甲状腺功能亢進，慢性肾上腺皮质功能减退症，垂体前叶功能减退症，糖尿病。 (9)尿毒症、糙皮病、放射性肠炎、硬皮病。 (10)痉挛性结肠(过敏性结肠炎)、神经精神性腹泻。

慢性肠炎泛指肠道的慢性炎症性疾病，其病因可为细菌、霉菌、病毒、原虫等微生物感染，亦可为过敏、變態反应等原因所致。长期过度疲劳、情绪激动、过度精神紧张，加以营养不良，都可成为慢性肠炎的诱因。也可继发于咀嚼障碍、胃酸缺乏、胃大部切除术后、肠道寄生虫病等疾患。

病变多由急性肠炎延治或误治诱致，胃肠粘膜冲血、水肿、渗出、逐渐加重，其表面片状黄色渗出物，呈弥漫性形成;粘膜皱壁层糜烂面加深或流血量大;表层上皮细胞坏死脱落更加严重，因粘膜血管损伤严重伴流血，更明显可见血浆外渗，粘膜下层有流血，水肿甚穿孔，或发现肠粘膜紊乱、肠痉挛、肠曲缩短，胃肠或肠曲之间瘘管、结肠袋形成加深或消失、充盈缺损等等，有时可伴发肠憩肉，或直肠癌、结肠癌病变。