怀孕三个月肚子疼拉肚子的原因较多，包括饮食不当、肠道感染、腹部着凉、肠道疾病以及孕期激素变化等。需要根据具体情况采取相应措施。若感身体不适，请立即寻求专业医疗帮助，遵循医生指导进行治疗，切勿随意服药。
1.饮食不当：如果食用了不洁食物、生冷食物或刺激性食物，可能导致胃肠功能紊乱。此时应调整饮食，选择清淡、易消化的食物，如米粥、面条等。
2.肠道感染：细菌（如大肠杆菌）或病毒（如轮状病毒）感染肠道，引起炎症反应。需进行粪便检查明确感染类型，细菌感染可在医生指导下使用阿莫西林、头孢呋辛等抗生素；病毒感染通常具有自限性，以对症治疗为主，如蒙脱石散止泻。
3.腹部着凉：腹部受寒后，肠道蠕动加快，出现肚子疼拉肚子。要注意腹部保暖，可适当热敷。
4.肠道疾病：如结肠炎、直肠炎等，炎症刺激肠道黏膜。可能需要使用柳氮磺吡啶等药物进行抗炎治疗。
5.激素变化：孕期体内激素水平波动，影响肠道平滑肌的收缩和蠕动功能。一般通过调整生活方式，如规律作息、适当运动，症状多可自行缓解。
总之，怀孕三个月出现肚子疼拉肚子的情况，孕妇不可掉以轻心。应尽快就医，查明原因，在医生的指导下进行治疗。同时，要注意饮食卫生，做好腹部保暖，保障自身和胎儿的健康。