子宫内膜异位症患者免疫功能异常的原因和结果关系较为复杂。可能是由于子宫内膜细胞的异位种植和生长，引发炎症反应，导致免疫功能失衡；也可能是免疫功能先出现异常，使得子宫内膜细胞更易异位种植。同时，激素水平变化、遗传因素、环境因素以及神经内分泌调节异常等也可能参与其中。 1.子宫内膜异位种植：子宫内膜细胞突破子宫腔，在其他部位种植生长，引发炎症，影响免疫功能。 2.激素水平变化：雌孕激素失衡，影响免疫系统的调节，增加子宫内膜异位症发生风险。 3.遗传因素：某些基因的突变或多态性，可能导致免疫调节相关基因异常，易患子宫内膜异位症。 4.环境因素：长期暴露于有害物质，如化学污染物、辐射等，损害免疫系统，促进疾病发展。 5.神经内分泌调节异常：神经递质和内分泌激素的紊乱，影响免疫细胞的功能和分布。 总之，子宫内膜异位症患者免疫功能异常的原因和结果相互交织。明确其机制对于疾病的诊断、治疗和预防具有重要意义。

有项大样本的统计学研究报道：子宫内膜异位症患者合并有红斑狼疮或其他自身免疫性疾病的人数是其他疾病患者人数的2倍。基础研究的结果也支持子宫内膜异位症可能为一种自身免疫性疾病的观点。 另外有种理解是认为妇女免疫功能正常的情况下，月经期经输卵管逆流入腹腔内膜细胞是被腹腔内巨噬细胞为主的局部免疫系统所灭杀。若局部细胞免疫功能不足或因逆流而至腹腔内的内膜细胞数量过多，免疫细胞不足以灭杀时，即可发生子宫内膜异位症。故目前认为子宫内膜异位症患者既可以有体液免疫即B细胞应答反应增强，亦可有细胞免疫即T细胞