根据有无合并食管气管瘘的病理解剖特点，临床上将会出现不同的症状。母亲有羊水过多，患儿自生后第1～2天表现有唾液过多、带泡沫的唾液从口腔、鼻孔溢出，有时发生咳嗽气喘、青紫。吃奶饮水后立即出现呛咳，且奶及水自鼻孔和口腔溢出。以后每次喂奶及水均有同样症状发生。体检时发现Ⅲ型食管闭锁，因大量气体从气管通过下段食管进入胃肠道，发现腹部显著胀气。Ⅰ型胃肠道内无气。管闭锁一气管瘘一般分为5型：Ⅰ型：食管上、下段闭锁，无食管气管瘘(4%～8%)，两段距离甚远。由于近端食管盲端分秘物积聚，不能进入胃肠道，并且与气管不通，而出现唾液分泌物从口腔内大量流出.特别是哺乳或喂水时，立即就可以将喂入的乳汁或糖水全部呕出，同时因误吸，可以呛咳或窒息。同时因为口腔内的分泌物及气体不能进入胃肠道内·所以患儿出现舟状腹。该型病人约有85%出现羊水过多.因此，在接生时，如果发现羊水过多，且新生儿口腔内有过多的分泌物，医护人员就应该注意观察新生儿有无先天性食管闭锁的存在。Ⅱ型：食管上段瘘管与气管相通，食管下段盲闭(0.5%～1%)，两段距离也甚远。Ⅲ型：食管上端闭锁，下段有瘘管与气管相通(85%～90%)，在此型中有些病儿上、下两段相距超过2cm(ⅢA)，食管Ⅰ期吻合术相当困难;有些病例相距1cm左右(ⅢB)，食管Ⅰ期吻合多能成功。Ⅳ：食管上、下两段皆与气管相通成瘘(1%)。Ⅴ：无食管闭锁，但有瘘与气管相通，即单纯气管食管瘘(2%～5%)。