当前医学水平还没有治疗肾囊肿的特效方法。对于小的肾囊肿，无症状时不需要做任何治疗，但要定期复查，观察囊肿是否继续增大。无症状者应经常进行尿液检查，包括尿常规、尿培养，每半年至一年进行一次肾功能检查，包括内生肌酐清除率。由于感染是该病恶化的重要原因，所以若非十分必要，不要进行尿路创伤性检查。

肾囊肿一搬是种良性病，小的囊肿不会影响肾功能，所以一般来说囊肿小于3cm良性发展没有什么不适症状者不需治疗，要定期检查观察囊肿的变化。无症状的患者应经常进行尿液检查，包括尿常规、尿培养，每半年至一年进行一次肾功能检查，包括内生肌酐清除率。由于感染是双肾囊肿恶化的重要原因，所以若非十分必要，不要进行尿路创伤性检查。多久复查一次?根据各人情况，一般3-6个月，如果长的慢，可以一年复查一次，如果长的快，可以适当增加复查频率。但是囊肿是不断增长的，小的囊肿不会影响肾功能，但是大的囊肿就会影响肾功能，所以当务之急要在囊肿还小的时候就一行字住囊肿的增长，把囊肿控制在小的范围内的话，肾囊肿就不会影响患者的正常生活!而大于等于3cm的患者要采用中医保守治疗，在此推荐肾囊消肿方，主治由各种病因导致的肾囊肿顽疾，此方易吸收，见效快，能迅速除疼痛、抑囊液、消囊肿、调机理、固根本，有效治愈肾囊肿顽疾。除了上面的处理方法外，要注意饮食护理方面的保健，因为病是三分治七分养，
1、调整饮食助营养慢性肾病病人一般都伴有营养不良，因而在饮食上应调整好，以鸡蛋、牛奶、瘦肉、新鲜蔬菜等食物为宜，并避免吃“发物”的食物，如狗肉、虾、螃蟹等，同时应忌烟禁酒。
2、不可轻视防感冒感冒属全身性疾病，能使免疫功能下降，常继发感染。据报道，因感冒而使近40%的慢性肾炎症状加重，而慢性肾炎是慢性肾功能衰竭第一位的原发性疾病。故在日常生活中应十分重视预防感冒。
3、劳逸结合重休息研究表明，人劳累后(包括性生活不节引起的劳累)，体内代谢产物增多，增加肾脏工作量，对肾病患者是不利的，可使病情加重。故劳逸结合，避免过劳，适当休息有利肾脏功能康复。
4、保持乐观向上的思想情趣，树立战胜疾病的信心。
囊肿性疾病是先天和后天各种因素相互作用的结果，科学研究发现所有这些因素都是可以改变或加以控制消除的，因此，千万不可悲观失望，况且乐观向上的思想情绪可以提高人的免疫力，有利于战胜疾病。但另一方面也要克服"轻敌"思想，积极地进行治疗。