目前的医学水平还没有治疗肾囊肿的特效方法。对于小的肾囊肿，无症状时不需要做任何治疗，但要定期复查，观察囊肿是否继续增大。无症状者应经常进行尿液检查，包括尿常规、尿培养，每半年至一年进行一次肾功能检查，包括内生肌酐清除率。由于感染是本病恶化的重要原因，所以若非十分必要，不要进行尿路创伤性检查。肾囊肿穿刺作用不大，不仅易于感染，易于复发，而且经过长期观察，该术也不能延缓肾功能损坏的发生。手术切除囊肿也不是一件容易的事，因为肾表面的囊肿可以切掉，但要切掉埋在肾脏深部的囊肿就相当困难。肿物较大且有恶变可能时，可以进行手术探查，如果证实为良性囊肿，可将肾表面的囊壁切除，边缘用肠线与肾实质连续缝合，残留囊壁涂以碘酊。一侧肾实质广泛破坏，对侧肾功能正常者，可行肾切除术。

是有多发性肾囊肿的情况.肾囊肿是肾脏内出现大小不等的与外界不相通的囊性肿块的总称,多发性肾囊肿可含概为成人型多囊肾、单纯性肾囊肿和获得性肾囊肿.成人型多囊肾是一种先天性遗传性疾病这个情况建议到正规的大型医院做手术治疗为宜,一般情况下首选微创手术治疗,这样对于身体的损伤性是最小的.一般情况下到三甲级别的医院做手术是比较保险的,手术后需要注意有适量的运动和注意营养的搭配。