生殖器疱疹早期症状的患者好发于包皮系带、冠状沟、包皮、尿道、阴茎、肛门周围和阴囊。病初为淡红或污红色粟状大小赘生物，性质柔软，顶端稍尖，逐渐长大或增多。生殖器疱疹早期症状可发展成乳头状或囊状，基底稍宽或有带，表面有颗粒。在肛门部常增大，状如菜花，表面湿润或有出血，在颗粒间常积存有脓液，散发恶臭气味，搔抓后可继发感染。 生殖器疱疹早期症状有初发时，大都为微小淡红色小丘疹，皮疹逐渐增大或增多，互相融合和重叠，呈凹凸不平的乳头状。由于引起生殖器疱疹的hsv类型、感染时间的长短、受感染者的个体、性别、部位等不同而出现大小不等、形状各异的表面症状等多种生殖器疱疹早期症状。小者仅肉眼可见，大者可覆盖整个外阴和肛门，有阴茎癌样，有色素痣样，有点滴状，有条索状，有菜花状，有叶状，有斑快状，有蛎壳状，有结节状，有针刺状，有丘疹状，有丘疱沫状，有鸡冠状，有蕈样，有泡沫样等一系列生殖器疱疹早期症状。

在早期，多数患者一般无症状。损害大小及形状不等，可仅为数个，亦可为多数针头样大的损害。在阴肛部可长成大的肿瘤样物，有压迫感;有恶臭味;有时小的生殖器疱疹可出现阴部痛痒不适，病人可出现尿血和排尿困难;直肠内生殖器疱疹可发生疼痛、便血，而直肠内大的生殖器疱疹则可引起里急后重感。

生殖器疱疹在早期，会出现锥状小肉粒小丘疹，一般发生在外生殖器、肛周，多数是粉红色、菜花状，其表面很脆，用手很容易弄掉，同时也是很容易出血及感染。皮肤表面出现米粒大小的表面症状，会随时间增长，可达到直径10多公分，而且生长迅速，有的会像菜花大小。