男性生殖器在尿尿时疼痛，可能由尿道炎、前列腺炎、膀胱炎、尿路结石、生殖器外伤等引起。 1.尿道炎：多由细菌感染所致，常见致病菌有大肠杆菌、淋球菌等。患者会出现尿频、尿急、尿痛等症状。治疗常使用左氧氟沙星、头孢曲松钠、阿奇霉素等药物，需遵医嘱。 2.前列腺炎：可由病原体感染、久坐、酗酒等因素引发。除尿痛外，还可能有下腹疼痛、性功能障碍等。治疗药物包括环丙沙星、坦索罗辛、前列舒通胶囊等，用药请遵医嘱。 3.膀胱炎：细菌通过尿道逆行感染是常见原因。主要表现为尿痛、尿频、尿急，甚至血尿。治疗可选用阿莫西林、呋喃妥因、三金片等，务必遵医嘱用药。 4.尿路结石：结石刺激尿路黏膜可致尿痛，还可能伴有血尿、肾绞痛。较小结石可通过多喝水、多运动排出，较大结石可能需体外冲击波碎石或手术治疗。 5.生殖器外伤：如骑跨伤等导致生殖器损伤，尿尿时会疼痛。需根据损伤程度进行处理，可能包括清创、缝合等。 总之，男性生殖器尿尿时疼痛的原因较多，如果症状持续不缓解或加重，应及时到正规医院泌尿外科就诊，明确病因，进行针对性治疗。