五岁儿童个子瘦小且膝盖疼，可能是生长痛、营养不良、缺乏运动、骨骼疾病、微量元素缺乏等原因所致。需要综合考虑，明确诊断。身体不适时，应尽快寻求专业医疗意见，遵循医生的建议进行治疗，切莫自行开处方。
1.生长痛：这是儿童常见的生理性疼痛，多因骨骼生长速度较快，肌肉和韧带被牵拉引起。疼痛通常发生在夜间，可自行缓解。
2.营养不良：若孩子饮食不均衡，蛋白质、钙等摄入不足，会影响生长发育，导致个子瘦小和膝盖疼。
3.缺乏运动：运动量过少，肌肉力量不足，关节稳定性差，易出现膝盖疼，也不利于身体生长。
4.骨骼疾病：如关节炎、滑膜炎等，会引起膝盖疼痛，影响孩子正常活动和生长。
5.微量元素缺乏：钙、维生素 D 等缺乏，会影响骨骼发育，导致个子瘦小和膝盖疼。
总之，五岁儿童出现个子瘦小且膝盖疼的情况，家长应重视。建议及时带孩子到正规医院的小儿科就诊，进行相关检查，如微量元素检测、膝关节 X 线或超声检查等，以明确原因，采取针对性的治疗措施。同时，要保证孩子饮食均衡，适当增加运动，促进身体健康成长。