新生儿呼吸窘迫综合征可能导致气漏、氧中毒、恢复期动脉导管开放等，还可能有其他影响。如果身体不适，请尽快寻求医疗帮助，按照医生的嘱咐进行治疗，切莫自行用药。
1.气漏：气体进入胸腔或纵隔等部位，影响呼吸。
2.氧中毒：长时间高浓度吸氧对肺等器官造成损伤。
3.恢复期的动脉导管开放：增加心肺负担。
4.肺部感染：抵抗力弱，易发生感染。
5.支气管肺发育不良：影响肺功能。
新生儿呼吸窘迫综合征的后遗症可能对患儿健康产生长期影响，需要密切关注和及时治疗。

新生儿呼吸窘迫综合征的并发症多发生在氧气治疗过程中或在治疗后的恢复期，重症常并发肺动脉高压，呼吸与心力衰竭。
1、气漏 由于肺泡壁的损伤，气体溢至肺间质，或由于机械通气时吸气峰压或平均气道压(MAP)过高引起间质性肺气肿，气体沿血管至纵隔，引起纵隔气肿，间质气肿也可引起气胸，气漏时呼吸更为困难。
2、氧中毒 当吸入氧浓度(FiO2)过高，或供氧时间过长，可能发生氧中毒，以支气管肺发育不良(bronchopulmonary dysplasia，BPD)和眼晶体后纤维增生最常见，前者为肺本身的病变，使呼吸机不易撤除，后者表现为晶体后视网膜增生或视网膜剥离，使视力减退，甚至失明。
3、恢复期的动脉导管开放 本症经机械呼吸和供氧治疗后，在恢复期约30%病例出现动脉导管未闭，早产儿动脉导管的组织未成熟，不能自发关闭，但在肺透明膜病的早期肺血管阻力增加，不但不发生左向右分流，有时却相反发生右向左分流，至恢复期肺血管阻力下降，即可出现左向右分流，此时因肺动脉血流增加而致肺水肿，出现间歇性呼吸暂停和充血性心力衰竭，甚至危及生命，在心前区胸骨左缘可听到收缩期杂音，以第2～3肋间最响，如肺血管阻力下降幅度大，甚至可出现连续性杂音，胸部X线片显示心脏影扩大，肺野充血，B型超声心动图可直接探得未闭的动脉导管。