新生儿咽下综合征的病因：
1.妊娠早期时，羊水主要是从母体血清经胎膜进入羊膜腔的透析液，胎儿血循环形成以后，水分及小分子物质可通过尚未角化的胎儿皮肤，也是羊水的一个来源。妊娠中期以后胎儿尿液排入羊膜腔，使羊水的渗透压逐渐降低，尿酸、肌酐量逐渐升高。另一方面，胎儿又通过吞咽羊水来取得量的平衡。此时胎儿皮肤逐渐角化，不再是羊水的来源。
2.妊娠晚期，羊水的运转除胎尿的排出和羊水的吞咽这两条重要途径以外，胎肺吸收羊水也是一个运转途径。此外，胎盘胎儿面的羊膜是水和小分子溶质的交换场所，但其量较小。羊水的来源受多种因素的影响，羊水的量和成分是水和小分子物质在母体、羊水和胎儿三者之间进行双向交换取得动态平衡的结果。羊水量承受着妊娠的进展不断增加，妊娠8周时，羊水量为5至10毫升，妊娠20周时达到400毫升，至4至8周时是最高峰，约为1000毫升，以后量逐渐减少，到足月妊娠时平均为800毫升左右。正常情况下，胎儿在宫内可吞入少量羊水，对胎儿的胃黏膜并无刺激。但在分娩过程中，胎儿如吞入羊水量过多，或吞入被胎粪污染或已被感染的羊水，或含较多母血的羊水，即可发生新生儿咽下综合征。